This is a demo application. (1) Please check the other three tabs, too (Sequence 1, Sequence 2, and BLAST tab). Then, Please copy the appropriate sequence (2, 3, 4). ( (2) please place the cursor over the position on the nucleotide sequence you want to copy. ) ( (3) please select and copy a DNA sub-sequence of the desired length. ) ( (4) Click on the BLAST-tab. ) (5) Paste the sub-sequence into the query-box in the BLAST-tab. (6) Click the Exec button. (7) Finally, please confirm whether the application is showing the output of blastn command. The application for using to answer the IBO2020Challenge-exam is different from this demo version. However, the basic operation will be same. On the application, you will use not only NCBI-BLAST, but also other analysis tools, too. ============================================ これはデモアプリケーションです。 (1)他の三つのタブ、Sequence 1、 Sequence 2、 BLAST、も確認してください。 Sequence 1タブから、配列の一部をコピーしてください。(2, 3, 4) ( (2) コピーしたい塩基配列の開始位置にカーソルを合わせてください。) ( (3) コピーしたい塩基配列の範囲を選択し、コピーしてください。) ( (4) BLAST-tabをクリックしてください。) (5) BLASTタブの配列問い合わせ窓にペーストしてください。それから、 (6) Execボタンをクリックしてください。 (7) 最後に、blastnコマンドの結果が出力されるのを確認してください。 IBO2020Challengeの本番試験で用いるアプリケーションは、このdemo版のアプリケーションとは異なるものです。ただし、基本的な操作はこのdemo版と変わりません。 そのアプリケーション上では、このdemo版のようなNCBI-BLASTだけでなく、いくつかの解析ツールも利用することになります。

Organism 1, Nuclear Genome


      

Organism 2, Nuclear Genome


      

Blast Search

Blast Result